肛门疖肿是否可以自愈，需要根据病情严重程度进行判断，不能一概而论。
1、一般可以自愈的情况：可能是不注意局部的清洁与卫生，导致金黄色葡萄球菌感染引起的，如果患者症状不严重，只是单纯出现轻微的红肿、疼痛等症状。通过局部清洗，及时更换纯棉内裤，通常能够达到自愈的目的。
2、一般不可以自愈的情况：若症状比较严重，出现身体发热、化脓、破溃等症状，如果不及时治疗，可能会引起蜂窝织炎、脓毒症等并发症，对身体造成严重影响。
如果不能自愈，患者可以在医生指导下涂抹鱼石脂软膏、莫匹罗星软膏等药物治疗，能够促进病情恢复。
