阴囊根部隐隐作痛的常见病因包括阴囊水肿、腰椎间盘突出症、附睾炎、精索静脉曲张和睾丸扭转，患者需要查明原因再对症治疗。
1.阴囊水肿：阴囊水肿可能是由于淋巴管阻塞、感染、损伤或过度使用引起的。建议患者注意局部清洁卫生，穿着宽松舒适的内裤，避免过度使用阴囊。
2.腰椎间盘突出症：腰椎间盘突出症可能会导致神经根受压，引起阴囊疼痛。建议患者进行物理治疗，如理疗和按摩等，或在医生的指导下使用镇痛药进行缓解，如布洛芬、扑热息痛等常用的镇痛药。
3.附睾炎：附睾炎常常是由细菌感染引起的，症状包括阴囊肿胀、疼痛和发热等。建议患者及时就医，接受抗生素治疗，如青霉素、头孢菌素、红霉素等，并注意个人卫生，避免感染。
4.精索静脉曲张：精索静脉曲张是由于精索静脉瓣膜功能失调引起的，而且多发生在站立或行走时。建议患者穿着紧身内裤，避免长时间站立或行走，同时可以采取物理治疗，如穴位按摩和冷敷等。
5.睾丸扭转：睾丸扭转是睾丸发生旋转，导致血液供应中断，是一种紧急情况，需要立即就医。患者应该立即前往医院，接受手术治疗，以避免睾丸坏死。
需要注意的是，阴囊疼痛是一种常见的症状，但是病因可能不同，患者应该及时就医，进行正确的诊断和治疗。同时，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和感染，也有助于缓解症状。